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物种形成/ DNA条码技术

物种形成和DNA条形码是利用相同序列数据的独特项目. 因此, 通过序列的收集和系统发育分析,可以对这两个目标进行推断.

物种形成

褐藻的分类是高度未解决的,有很多要研究的物种形成事件. 了解褐藻的进化历史有助于im电竞登录更好地对藻类进行分类, 了解海藻在海洋盆地之间的运动, 从单细胞到多细胞的转变, 流动状态对进化的影响. 对物种形成事件的研究通常需要一个以上的基因区域才能对物种形成事件做出推断.

DNA条码技术

DNA条形码已成功地用于对红藻、绿藻和一些褐藻的研究. DNA条形码是一种短的基因区域,一旦被测序,就能清楚地表明物种的身份. 选择用分子而不是形态变异来鉴定物种,避免了由于高的表型可塑性而导致的误认问题. 有效的DNA条形码大约有700个碱基对,集中在一个或部分基因区域.

布莱恩分析凝胶.Eisenia arborea

海带林是世界各地温带潮下群落中非常高产的生态系统. 过去的研究表明,浅层和深层潮下带之间的水流和水动力压力差异可能会塑造藻类的形态. Eisenia arborea 是一个在卡塔琳娜岛附近的浅滩和深水潮下带海带物种的例子吗, 加州, 每个都有不同的形态. 形态分化是由表型可塑性还是遗传差异引起尚不清楚. 这项研究的目的是确定这些种群是否仍然是一个物种适应两种不同的环境,或已多样化到足以被认为是两个不同的物种. 从这两个潮下种群中采集样本并提取DNA. Based on the difference in polysaccharide content from the total genomic DNA extractions; variation between these two populations were evident. 两个基因区域, 扩增1个细胞核(LSU [Z片段]的5 '端)和1个线粒体(cox 1 5 '端)并测序. LSU Z片段的系统发育分析 考克斯1 5 ' 基因区表现出显著的遗传变异. 两者都显示出了作为DNA条形码/标记来区分浅层或深层种群个体的希望. 对这两个种群的两个基因区域进行进一步的测序和系统发育分析,将会得到令人兴奋的结果.

DNA条码技术在 海藻

海藻 是最重要的生态和广泛分布的褐藻属之一吗. 在世界各地的热带至亚热带海洋盆地,该属通常形成远洋浮床或大型沿海站. 然而, 关于它的进化史和系统发育,还有很多东西有待发现, 但由于无法100%准确地识别物种,这一进展受到了阻碍. 鉴定的问题是由于高的表型可塑性和隐种率,以及缺乏对加勒比的研究 海藻 物种. 在巴拿马的沿海地区尤其如此, 那里的物种多样性估计很高,有许多潜在的未被发现的物种. DNA条形码的发展 海藻 能否解决传统的基于形态学鉴定的问题,并为系统发育分析提供数据. 这个项目的目标是比较三个基因区域的条形码效用, 并利用这些数据对分辨率做出贡献 海藻的发展史. 在巴拿马周围的加勒比海和太平洋地区获得了21个样本. 采用改良的CTAB法提取样品,基因组法扩增全基因组,保存DNA. 选择几个基因区域进行扩增(e.g. 路易斯安那州立大学, 加拿大皇家银行L和ITS-2)并测序. 所有21个样品均成功提取,全基因组扩增产物存档以备将来使用. 利用新的和GenBank数据,正在为该属建立单个基因区域的主比对. 系统发育分析产生了一棵最大似然自举树,表明LSU片段Z没有足够的变异来发挥条形码的功能. 未来的研究方向是将LSU Z与LSU的另一个片段或其他基因区域配对. 

Ascoseira

Ascoseria 是南极洲恶劣环境中特有的一种藻类. 子囊藻目,像其他褐藻目一样,有一个高度未解决的分类. Ascoseira君子兰 表现出不同的形态区域之间的湍流和安静的流动状态. 柄长差异是由于表型可塑性还是适应性进化的变化尚不清楚. 标本采集自三个不同的地区, 提取总基因组DNA,扩增ITS-2和ITS-2区域 加拿大皇家银行L被执行. 序列比对并进行系统发育分析. 在基因区域中发现的变异不足以确定这两个种群之间是否发生了物种形成. 未来的研究将集中在其他几个基因区域以及Radtag分析上.